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稻属最(zui)全超等泛基因组(zu)图谱成功绘(hui)制,栽(zai)培(pei),鉴定(ding),团队(dui)
2024-12-05 15:22:44

科技日报讯 (记者魏依晨)记者12月2日获悉,我国工程院院士(shi)、江西省农业科学院研究员颜龙安团队(dui)团结河北大学教授杜会龙团队(dui)成功绘(hui)制了全球首个稻属最(zui)全超等泛基因组(zu)图谱。相关研究结果正在线(xian)发表于《自然·通讯》。

该研究组(zu)装了稻属13个近乎(hu)完美的野生稻种基因组(zu),并结合已(yi)公开的普通野生稻、亚洲(zhou)栽(zai)培(pei)稻和非洲(zhou)栽(zai)培(pei)稻基因组(zu),构建了包(bao)含(han)101723个基因家族的稻属超等泛基因组(zu)。其中,稻属共有的核心基因家族仅占9.84%,共鉴定(ding)到63881个栽(zai)培(pei)稻中尚未发现的新基因家族,使(shi)可利用的水稻基因扩大了1.7倍。同时,基于高质(zhi)量的基因组(zu)图谱,团队(dui)首次正在基因组(zu)水平重构了稻属的进化关系。

该研究还(hai)从(cong)分歧材料中鉴定(ding)到2781到10656个插(cha)入序列、2680到10419个缺失序列、4到52个易位以(yi)及7到22个大倒位等布局变异,首次从(cong)基因组(zu)变异和等位变异水平解析了野生稻与栽(zai)培(pei)稻的多样性。

正在抗(kang)病基因方面,团队(dui)结合基因组(zu)注释和RGAugury等多种方法,正在稻属中共鉴定(ding)到7048个抗(kang)病基因,其中栽(zai)培(pei)稻有237个抗(kang)病基因家族,野生稻有384个抗(kang)病基因家族。这(zhe)揭示了栽(zai)培(pei)稻的抗(kang)病基因偏向于成簇存正在,而野生稻的抗(kang)病基因则(ze)主要以(yi)单(dan)个形式存正在。

此外,团队(dui)还(hai)正在野生稻中鉴定(ding)到207个串联反复基因,其中36个与产量、抗(kang)性、品质(zhi)、生育期、营养(yang)元素高效利用,以(yi)及生物和非生物勒迫耐受性相关。

该研究构建的稻属超等泛基因组(zu)极大扩展(zhan)了水稻遗传改进的基因池。这(zhe)对野生稻种质(zhi)立异利用具有重要理论意(yi)义和应用价值,同时为稻属进化和驯化研究供应了支持。

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